CHS基因外显子2的进化规律及其用于植物分子系统学研究的可行性

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CHS 基因的外显子2在进化中较为保守. 用PCR方法, 从低等的裸子植物(银杏、攀枝花、苏铁)和被子植物(玉兰、睡莲、垂柳、山茶)中成功地扩增了CHS基因外显子2的部分序列, 长约860 bp. 对这些序列与已发表的序列(合计19个科 83个序列)进行最简约性分析, 结果表明, 对于大部分科, 同一科的序列形成一组, 而少数科的序列则分散在相距较远的分支中. 用CHS基因全长编码区的DNA序列构建的最简约树与用其外显子2构建的最简约树相同. 相对进化速率检测结果显示, CHS基因在不同科中进化速率不一致, 菊科和茄科的非同义替换率与总的碱基替换率均很高, 禾本科的非同义替换很快, 而总的碱基替换并不快. 从目前的结果来看, CHS 基因家族的成员在不同科中的重复和丢失事件的式样不一样, 因此, 很难找到在不同科中直系同源的成员来进行被子植物科间的系统发育研究, 但可用它进行科以下分类等级的研究.
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