VFA:一种可视化代谢网络建模工具

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数学建模是代谢工程研究的关键方法之一:目前的代谢网络建模工具在构建代谢通量分析模型时,不能同时建立通量平衡分析(FBA)模型和^13C代谢通量分析(^13C—MFA)模型,而且大都采用私有格式描述代谢模型,不利于信息共享。为了解决上述问题,作者基于Cytoscape插件开发了一种可视化代谢通量建模工具VFA,它摆脱了繁琐、易出错的文本建模方式,提供友好的图形化用户界面、方便的可视化建模功能,并能够同时对代谢网络进行FBA和^13C—MFA建模。VFA的代谢模型描述格式扩展自系统生物学标记语言(SBML),
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