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为提高蛋白质折叠结构的预测精度,提出了一种融合改进模拟退火算法与序列二次规划法的预测策略.将序列二次规划法加入具有回火退火功能的模拟退火算法中,利用其局部最优化的能力对由模拟退火算法求得的全局优化结果进行二次优化,进而求得全局最优化结果.对所提方法进行了计算机仿真研究,并与其它方法进行了性能比较,实验结果表明,该方法能够有效提高蛋白质折叠结构的预测精度.