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通过现场调查,分析了重庆市重要水源地在污水、垃圾、沟渠、农业面源污染、水土流失、人居环境等方面存在的问题,探讨了重庆市生态清洁小流域（重要水源地）建设理念与思路。研究表明,根据地形地势及人类活动情况,因地制宜、因害设防从山顶到水源区周边依次建设“生态修复、生态治理、生态保护”水源保护三道防线进行清洁小流域（重要水源地）治理措施布设,可为重庆市后续生态清洁小流域（重要水源地）建设提供参考。