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【目的】研究分析健康犊牛直肠细菌的多样性。【方法】通过建立直肠菌群16S rRNA基因克隆文库，分别用限制性内切酶Msp I和Hha I对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切片段长度多态性（RFLP）分析，通过测定16S rRNA基因序列，绘制进化树，确定健康犊牛直肠菌群的组成。【结果】克隆阳性率达96.45%（488/506），Msp I得到64种分类操作单元（OTU,Operational Taxonomic Unit），Hha I得到45种OTU，综合获得143种OTU。测序比对表明健康犊牛直肠优势菌