与降水事件密切相关的土壤水分有效性是荒漠生态系统土壤呼吸的重要驱动因子。研究了固沙植被区以藓类和藻类为主的生物土壤结皮斑块土壤呼吸对模拟降雨(5、10、20mm)的响应。结果表明:3种降雨量对不同结皮斑块土壤呼吸均有显著的激发作用,但2种土壤的响应特征不同。藓类结皮斑块土壤呼吸速率在降雨后0.5h达到最大值,而藻类结皮斑块土壤在降雨后2h达到最大值,其呼吸速率分别是降雨前土壤呼吸速率的43~58、21~25倍,随后,两类结皮斑块土壤呼吸速率逐渐下降并恢复到降雨前水平。随着降雨量的增加,藓类结皮斑块土壤最大呼吸速率和平均呼吸速率显著增大,而藻类结皮斑块土壤则无明显变化;2种土壤碳释放量均随着降雨量的增大而增加。在相同降雨条件下,藓类结皮斑块土壤呼吸速率峰值和平均值及碳释放量均显著大于藻类结皮斑块土壤。表明生物土壤结皮和降雨量均对荒漠生态系统土壤呼吸起着重要的调控作用。