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2014年3月云南地区发生H5N1亚型禽流感疫情。为了解引起该疫情的病毒全基因变异特征及遗传进化关系，我们在云南通海、安宁、大理采集死亡鸡喉气管40份，经H5N1亚型禽流感病毒（AIV）特异性多重RT-PCR检测。从检测结果呈阳性的26份样品中每个地区挑选2份病毒阳性样品进行全基因测序分析，结果显示6株AIVs均属于2．3．4．4进化小分支。同一病毒株不同基因节段呈现不同进化关系。蛋白序列的变化主要为：HA的受体结合位点和表位关键性氨基酸位点存在变异，新增加2个糖基化位点；NA缺失4个糖基化位点；PB2的