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密集饲养的猪只不断接触到致病微生物，导致它们的免疫系统不断被激活，好的方面是这种连续刺激会使它们的免疫系统增强，当然也可能是相反的结果。在后一种情况下，激活诱导无论是临床或亚临床形式的疾病状态，都会降低猪只对饲料中蛋白质的吸收率和日增重的减少。同时如果蛋白质的吸收率降低了，排泄物中的N就会增加，而N现在被认为是一种环境污染物。