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公立医院实行药品零差价销售是贯彻落实国家卫生制度改革方案的具体措施，对降低患者医疗负担，推进国家基本药物制度实施有着重要意义。实行药品零差价，如何将其有效地实行到具体的工作中，彻底打破了“以药养医”的现象，是一个应该思考的问题。文章通过可能产生的资金浮动、收入变化等问题进行分析，结合医院实行的临床路径和“单病种付费”等一系列改进措施，对专科医院面对药品零差价进行思考，并提出一点建议。