梅花鹿是我国极度濒危的鹿科动物,其野生种群已濒临灭绝。为了探讨我国野生梅花鹿的保护和管理对策,我们选用了16个微卫星位点检测来自东北、四川、江西和浙江种群的122份样品,以此分析我国野生梅花鹿种群的遗传多样性和遗传结构。费希尔确切性检验表明,四个种群中均存在偏离哈迪-温伯格平衡的现象。与其它的濒危动物相比,中国梅花鹿有着相对较高的遗传多样性:每个位点的平均等位基因数为4个,平均期望杂合度为0.559。四个种群中,东北种群拥有最高的平均等位基因数(n=3.688),东北种群、四川种群、江西种群以及浙江种群的平均期望杂合度分别为0.584,0.477,0.585和0.589,它们之间不存在显著的差异。同时,利用逐步突变模型、双相突变模型和无限等位基因突变模型检测了种群的瓶颈效应,结果表明:除四川种群外,其他种群在近期内都经历过遗传瓶颈。费希尔确切性检验及配对样品FST的结果均表明:四个梅花鹿种群间存在显著的遗传分化(P<0.001)。因此,我们建议将我国梅花鹿的野生种群划分为4个管理单元进行保护和管理。