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溶菌酶是一种专门作用于微生物细胞壁的水解酶，它专一地作用于肽多糖分子中N-乙酰胞壁酸与N-乙酰氨基葡萄糖之间的β-1、4键，从而破坏细菌的细胞壁，使之松弛而失去对细胞的保护作用，最终使细菌溶解死亡。可以直接破坏革兰阳性菌的细胞壁，而达到杀菌的作用，对某些革兰阴性菌，如大肠杆菌，也会间接的受到溶菌酶的破坏。