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首都医科大学心血管病学系于2005年1月22日成立,是首都医科大学在整合9所附属医院的心内科临床、科研和教学资源的基础上,形成学科发展的一种新模式。2007年被教育部批准为国家重点学科,2011年被国家卫生和计划生育委员会批准为国家临床重点专科。目前包括25家成员单位：首都医科大学附属北京安贞医院、朝阳医院、宣武医院、同仁医院、天坛医院、友谊医院、复兴医院、世纪坛医院、中医医院、儿童医院、地坛医院、康复医院12家三级医院。