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为了使新农合可持续发展，通过分析新农合运行中存在的一些问题，如医疗管理部门对新农合制度运行中存在的各种困难认识不足，医疗服务机构对新农合惠民服务理念认识不足；单纯使农民受益的报销政策，一定程度上刺激了医疗费用的增长，住院人数大，基金支出大幅增长，面临基金透支风险。提出加强领导、强化管理、完善制度，适时提高筹资的水平，改革新衣合报销政策、探索新衣合的管理机制、合理分配卫生资源，控制医疗费用不合理增长。合理分配新农合基金，设立门诊统筹基金，激发定点医疗机构在新衣合管理主动性等措施。