手塚治虫除了发明动画漫画工业体系之外，还有另一重要功绩，就是其作品本身的杰出成就。因为得益与工业化的优势，手塚治虫在世期间，创作了惊人数量的漫画和动画作品。
　　手塚创办了日本第一家漫画公司，又创办了第一家动画公司。可以说，草创期的日本动画工业，完全是围绕手塚治虫为核心而建立的。
　　早期，虫制作所推出的所有动画作品，全都是以手塚治虫的漫画原作为基础的。手塚治虫一生画了约450部漫画（一说700部），总销量超过一亿。其作品丰富多样——儿童生活、科幻、侦探、历史、传说，文学、医学、宗教、音乐、哲学等。可以说手塚治虫本身，就是一个取之不尽、用之不竭的宝库。
　　为了实现儿时的梦想——让漫画动起来，创造真正属于自己的漫画电影，手塚治虫作为一名成功的漫画家，却怀着极大的热情投身于动画事业。他认为动画是漫画的未来发展方向，是最为神奇的新生事物。所以在早期，一直用漫画公司的收入和盈利以及相关玩具产品的开发，补贴着动画公司早期庞大的开销。其对动画事业的执着和追求，也逐渐导致了后来负责动画制作的“虫制作”公司的倒闭和负责漫画版权业务的“手塚公司”之间的官司的经典案例。
　　即便采用有限动画的制作方式，当时一集动画播放，也至少需要30分钟的内容，就意味着至少需要画2000张画。当时只有5名动画家，每人每天需要绘制66张图，其工作强度可想而知。而其制作成本，仅仅为一集55万日元，相当于，一万元人民币，制作十分钟动画。即便放在当年物价非常低的年代，这笔制作费用也是非常少的。导致后来宫崎骏导演曾经抱怨：“手塚治虫的有限动画制作方式我还是能够理解的，它有积极的一面。但是当时他以55万日元一集的极低的动画制作价格，开了一个非常不好的头，导致了后来日本动画行业一直是处于零利润的边缘。严重影响了日本动画行业的发展和人才的培养。”而手塚之所以这么做的原因，就是为了让动画能够走进大众的视野，让自己漫画动起来的梦想，得以实现。
　　手塚治虫是医生出身，又经历过战争的年代。所以其作品里充满了悲天悯人的情怀、理性的思考、东方的智慧，以及对未来的思索。其一生，制作了14部实验动画作品，其中13部收录在《实验短片动画集》中。其中最有影响力的，是《森林传说》。该作分四个篇章，其中可以清晰地看到手塚治虫对于动画的理解，以及其发展的日本动画的风格变化轨迹。由最早的模仿美国迪士尼，到后来形成自己的日本动画的独特风格，以及不断地技术革新，动画制作质量的提升等等。手塚治虫虽然成立了动画公司，但是由其亲自担当导演的作品却不多。只有《缎带骑士》《克里奥帕特拉》《火之鸟2772》等少量几部电影动画。其中手塚治虫《一千零一夜》《哀伤的贝拉透娜》《克里奥帕特拉》三部电影动画的观众对象是成人，在其中可以直观地感受到手塚治虫的作品深度和导演手法。
　　当时手塚的动画公司刚成立，几乎所有国内对动画有热爱的人才都聚集在这里。那一时期，日本的动画公司只有两家，一家是专注于电视动画的“虫制作”，另一家是专注于电影动画的“东映”。手塚在公司里，给年轻人充分展示自己才华的机会，他们担当了一系列手塚动画作品中的要职——导演、原画、动画、摄影、背景等。其中的大部分人，后来出走之后，都成立了自己的动画公司。成为日本动画发展期的领军人物，也都是现在日本动画界的元老人物。