【摘 要】
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目的 分析保守序列CTAG在S.typhimurium DT 104的含量及分布情况,比较4个主要插入片段之间的相对进化时间规律,探究在所有沙门菌全基因组中CTAG所反映出的进化关系.方法 统计
【机 构】
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哈尔滨医科大学药学院实验中心,150081
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目的 分析保守序列CTAG在S.typhimurium DT 104的含量及分布情况,比较4个主要插入片段之间的相对进化时间规律,探究在所有沙门菌全基因组中CTAG所反映出的进化关系.方法 统计S.typhimurium DT104菌株4个插入片段(ST64B、ST104、ST104B及SGI1)的位置、CTAG含量及分布规律.将NCBI中下载的32株目的菌株分为3个水平,通过基因组序列比对方式统计其共有的保守序列CTAG所在位置及功能注释,结合菌株间进化关系加以分析.结果 保守序列CTAG在整个基因组进化中不断被清除,插入片段中CTAG分布频率较原基因组更高,且存在由中间向两端逐渐减少的趋势.沙门菌全基因组中尚存的CTAG所在位置涉及进化过程中的重要功能.结论 CTAG在沙门菌进化中为适应生存需要整体呈退化趋势,其含量及分布规律可以反映插入片段相对进化时间的远近.CTAG在细菌基因组进化过程中高度保守,可作为相关研究的补充衡量指标.
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