【摘 要】
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目的基于生物信息学探讨结肠腺癌中胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因表达的意义。方法采用GEPIA2分析工具分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库和GTEx数据库中结肠腺癌CTHRC1基因的表达及其与患者生存预后之间的关系;采用ULACAN分析工具分析TCGA数据库中CTHRC1基因在结肠腺癌组织和正常结肠组织中的甲基化水平。采用cBioportal网络分析工具分析CTHRC1基因突变。采用TIMER分析工具分析基因表达与免疫细胞浸润、肿瘤相关成纤维细胞浸润以及功能性免疫细胞之间的关系。采用STRIN
【机 构】
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湖北省十堰市太和医院妇产科 442000湖北省十堰市太和医院检验科 442000
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目的基于生物信息学探讨结肠腺癌中胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因表达的意义。
方法采用GEPIA2分析工具分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库和GTEx数据库中结肠腺癌CTHRC1基因的表达及其与患者生存预后之间的关系;采用ULACAN分析工具分析TCGA数据库中CTHRC1基因在结肠腺癌组织和正常结肠组织中的甲基化水平。采用cBioportal网络分析工具分析CTHRC1基因突变。采用TIMER分析工具分析基因表达与免疫细胞浸润、肿瘤相关成纤维细胞浸润以及功能性免疫细胞之间的关系。采用STRING数据库分析与CTHRC1相互作用的蛋白,并进行富集分析。
结果在结肠腺癌组织中,CTHRC1基因和蛋白的表达水平均高于正常结肠组织,差异均有统计学意义(均P
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