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目的:为进一步提升我国新药研发产出水平提供参考.方法:基于2005-2016年我国医药制造业经济和研发产出情况的调研数据,通过运用因子分析回归方法,实证研究投入能力、创新能力、支撑能力、政策力度等方面的因素对我国新药研发产出的影响.结果:新药研发(R&D)经费投入强度、集成创新能力、知识产权保护度每增加1％,有效发明专利数分别增加0.8％,6.45％,0.146％,而政府资金投入强度、企业数量、知识产权保护度每增加1％,新产品销售收入比重分别增加0.55％,8.19％,0.230％.结论:总体来看,集成创新能力、引进消化吸收再创新能力、市场竞争能力、政府资金投入强度、R&D经费投入强度、知识产权保护度等因素对研发产出的影响较为显著.