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分析了41个链格孢属(Alternaria)种和2个匍柄霉属(Stemphylium)种的5.8SrD-NA及ITS序列,并构建了系统发育树。对该系统发育树的分析表明,链格孢属种间分类比较混乱;某些种与匍柄霉属个别种的亲缘关系非常接近。链格孢属种间形态差异大的,可以根据序列分析加以区分,而形态差异小的则不能区分。