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采用第一性原理密度泛函方法，在考虑极化函数的双数字(DND)基组水平上，对α-[XMo12O40]^n-(X=P,Si，Ge)杂多阴离子进行了几何构型优化，得到了与X-ray晶体衍射实验结果相一致的结构参数；并在优化几何构型基础上进行了振动频率分析，首次得到了非经验计算的杂多阴离子的振动光谱，计算的频率及强度与实验结果总体上吻合得较好．对全部22个有红外活性(IR)和44个有拉曼(R)活性的频率进行了指认，并与经验方法得到的结果进行了比较，同时，对部分频率的归属加以进一步的澄清与确认．