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提出了一种针对高校二级学院的教学科研打通考核的方法及数学模型,分析了该考核方式的优势。以实践为依据,提出了以投入产出为依据的学校目标工作总量的确定及分配模型;提出了定量和定性相结合的教学和科研工作量分配比例的计算办法;提出了综合考虑职称结构差异、学科差异、不同减免类别差异的标准专任教师人数计算的数学模型。依据实践数据,提出了基于任务完成情况、纵向发展情况和院系规模差异的“标准人均增长额”概念,使各学院的发展状况更具有可比性。