【摘 要】
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以拟南芥的EIN3/EILs蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,搜索后获得4个EIN3/EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3/EILs基因家族的系统进化、序列相似性、
【机 构】
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内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室,包头师范学院生物科学与技术学院,
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以拟南芥的EIN3/EILs蛋白保守结构域为探针序列,对甜瓜全基因组的蛋白质数据库进行搜索,搜索后获得4个EIN3/EILs蛋白序列。对甜瓜EIN3/EILs基因家族的系统进化、序列相似性、基因结构进行了分析。通过对所有甜瓜的EIN3/EILs基因的表达谱分析得知该基因家族在各组织中均有表达,其中在果实以及愈伤组织中高丰度特异表达,不同基因之间的表达模式差异明显。
The EIN3 / EILs protein conserved domain of Arabidopsis thaliana was used as a probe sequence to search the whole melon genome database. After searching, four EIN3 / EILs protein sequences were obtained. The evolution, sequence similarity and gene structure of melon EIN3 / EILs gene family were analyzed. By analyzing the expression profiles of EIN3 / EILs in all melons, it was found that the gene family was expressed in all tissues, with high abundance in fruit and callus, and the expression patterns of different genes were significantly different.
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