【摘 要】
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目的 建立咽拭子标本中EV71和Cox A16型肠道病毒逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测方法.方法 根据GENBANK数据库中EV71和Cox A16型肠道病毒的基因序列,利用CLUSTAL软件进行序列
【机 构】
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深圳国际旅行卫生保健中心,广东深圳,518033
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目的 建立咽拭子标本中EV71和Cox A16型肠道病毒逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测方法.方法 根据GENBANK数据库中EV71和Cox A16型肠道病毒的基因序列,利用CLUSTAL软件进行序列比对分析,选择基因组的保守序列,并借助引物设计生物信息学软件,设计筛选出一套针对EV71和Cox A16型肠道病毒的RT-PCR扩增的引物.从特异性、最低检测限、重复性等方面进行评估,建立了EV71和Cox A16型肠道病毒RT-PCR检测方法.结果 RT-PCR方法对EV71和COXA16病毒的最低检测量分别为63 TCID50/ml和32 TCID50/ml.其他病原微生物及人类基因组在该系统无反应信号,显示方法特异性良好.结论 RT-PCR对手足口病病原体检测准确性高、特异性强,具有快速、经济等特点,适合手足口病的早期诊断.
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