【摘 要】
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主要利用蛋白质统计信息和氨基酸与疏水级映射关系,提出一种基于亲疏水性的替代矩阵HB62,解决蛋白质疏水级序列相似性计算问题.采用CB513数据集,分别利用Blosum62和HB62计算
【机 构】
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东北农业大学理学院,国家大豆工程技术中心
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主要利用蛋白质统计信息和氨基酸与疏水级映射关系,提出一种基于亲疏水性的替代矩阵HB62,解决蛋白质疏水级序列相似性计算问题.采用CB513数据集,分别利用Blosum62和HB62计算蛋白质问的相似程度,结果显示,两种方法计算结果具有一致性,验证了HB62的正确性与有效性.HB62的设计.极大地简化了蛋白质疏水级序列相似性计算问题,有效地降低预测算法复杂度,提高预测准确率,推动蛋白质亲疏水性的相关理论的发展.
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