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科学基金制已形成＂科学民主、平等竞争、鼓励创新＂的运行机制和决策、执行、监督、咨询相互协调的科学基金管理体系。但科学基金制却面临着科学基金法规不完善、绩效评估体系不健全、资金分配不公等诸多挑战,更需要制定科学基金法、健全绩效评估体系、加强基金调控等措施,以推动科学基金制的健康发展,促进科学基金文化的完善。