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为建立适用于发菜（Nostoc flagelliforme）蛋白质组研究的双向电泳技术，对发菜蛋白质的提取、裂解、上样量、IEF及SDS-PAGE电泳等关键步骤进行了优化，结果显示：发菜蛋白质主要分布在pH4～7范围内，采用改良TCA法可提高提取液中蛋白质的含量和双向电泳图谱的分辨率，裂解液含60mmol／LDTT，24cm IPG胶条上样量1．5mg时不仅提高了蛋白质的溶解性，而且改善了双向电泳的分离效果，得到近800个蛋白点，且蛋白点清晰，图谱分辨率较好。采用优化后的双向电泳体系提高了发菜蛋白质双向电