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在大数据时代背景下，数据分析技术广泛应用于提取海量数据中的有效信息。检验检疫行业形成了以CIQ2000综合业务管理系统为基础，以电子申报、电子监管、电子放行为主要内容的中国电子检验检疫建设格局，积累了大量来源不同、类型不同、时间周期不同、用途不同的结构化和非结构化数据。针对检验检疫业务数据的非线性特征，介绍了基于流形学习方法的大数据分析技术，探讨了其在检验检疫业务中应用的可能性。