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外源染色体片段或基因的准确鉴定对作物遗传改良具有重要的作用。尽管分子标记已被广泛应用到外源染色体片段或基因的检测上，但是对于大群体中少数几个阳性植株的鉴定，逐个检测的效率极低。本研究以陆地棉（Gossypium hirsutum L.）新陆早48号与海岛棉（G. barbadense）染色体片段置换系CSSL-122的BC2F1群体147单株DNA样本为材料，通过构建二维矩阵排列DNA样本材料，分别对待测样本按行、列进行混合，获得m个行的混合样本和n个列的混合样本；以 m=n=8 矩阵为例，对待检 m&#