免疫相关基因预后模型的构建对喉癌患者预后的影响

来源 :国际耳鼻咽喉头颈外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:missingmm
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目的 探讨基于生物信息学方法构建免疫相关基因(immune-related genes,IRG)预后模型以准确预测喉癌患者的预后.方法 从癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得111个喉癌组织和12个正常相邻组织之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEG).利用ImmPort数据库识别出差异表达的IRG.Cox单变量生存分析用于筛选与生存相关的IRG.差异表达的与生存相关的IRG被认为是预后相关的免疫基因.然后构建免疫基因预后模型计算患者风险值,受试者ROC曲线分析验证模型准确性.通过该模型行单因素、多因素独立预后分析证明其独立预测能力.最后分析关键免疫基因与临床病理参数的关联.结果 鉴定喉癌的DEG并筛选出IRG.接着与预后生存时间结合,鉴定8个关键免疫基因(CXCL11、RBP1、AQP9、CYSLTR2、BTC、STC2、UCN和FCGR3B)作为免疫基因预后模型,这种预后模型可以准确的将患者分为高危和低危人群.总体生存分析表明,高危患者的生存时间比低危患者要短(P<0.0001).模型的ROC曲线下面积为0.810,提示预后模型具有较高的敏感性和准确性.单因素和多因素Cox回归表明其为喉癌患者预后的独立预测因素.此外,我们发现模型中的5个关键基因与临床病理特征显著相关.结论 基于生物信息学方法构建喉癌的免疫相关基因预后模型,发现8个基因有助于预测喉癌患者的预后,其中5个与临床病理特征显著相关.
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