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合作学习作为一种加强学生互动协作，引导共同进步并提升教学质量的新型教学方法，已成为教学研究的重要内容。本文对协同育人机制下农业工程学科的合作学习应用进行了探索，并以农业生物环境工程课程为例进行课堂合作模式分析，调查结果表明，科教协同育人能够提升合作学习效果（P<0.01），75%以上的学生认为合作学习能够提升学习积极性、促进交流，超过80%的同学认为科教融合导向下的合作学习对拓展知识、深入了解行业现状和就业指导有积极效果。