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图们江流域具有独特的地理位置、气候条件和丰富的生物多样性，有包含森林、湿地、水域、河口等类型的生态系统，以及长白山、春化、枫梧沟等自然保护区。该流域生长着134科2091种高等植物和87科422种高等动物。其中国家级和省级一类珍稀濒危的高等植物94种，珍稀濒危的高等动物63种，有许多生物为本区特有种类。图们江流域的生物多样性对于吉林省乃至全国的生物多样性状况都具有极为重要的意义。