食管鳞状细胞癌长片段非编码RNA的筛选及验证

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目的 筛选与食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell cancer,ESCC)相关的长片段非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探讨食管鳞状细胞癌特异相关lncRNA与ESCC发生、发展的关系。方法选取30例未经治疗的ESCC患者,应用包含7419个lncRNA的lncRNA阵列(lncRNAarray)筛查了4例不同食管组织中lncRNA的转录和表达谱;其次,选取表达差异最大的一个lncRNA(ESCCAL-1)和已知肿瘤相关的长链非编码RNAHOTAIR,以GAPDH为对照,应用实时定量PCR对26例配对的食管鳞状细胞癌组织与正常组织中的表达情况进行了研究。结果通过系统的生物信息分析手段,在全基因组水平筛选出食管鳞状细胞癌特异相关lncRNA154个,其中下调的lncRNA111个,上调的lncRNA43个。在检测的26例患者中发现,相对于正常组织,ESCCAL_1和HOTAIR分别有17例、18例在癌组织中呈现高表达。结论筛选出食管鳞状细胞癌相关的差异表达lncRNA;同时发现ESCCAL-1、HOTAIR在70%左右ESCC癌组织中高表达,提示它们参与了食管鳞状细胞癌的发生过程,是潜在的ESCC诊断和预后标志物,其作用机理有待进一步研究。

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