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基于技术创新链的视角，将区域科技创新系统分为技术研发和技术应用与改造两个子系统，运用多阶段超效率DEA模型测度两个子系统及区域科技创新系统的发展水平；在此基础上，再采用协同发展度模型．对我国科技创新系统的协调发展度进行研究，发现我国区域科技创新系统发展水平整体呈现偏低，其协调发展度也处于“弱协调”状态，且各地区之间的差异较大。依据其协调发展度的状态将我国各省区划分为四类，深入分析协调发展度的特征和原因，针对不同的类型提出针对性的政策建议。