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链球菌病感染常常很复杂，因为猪的扁桃体内和鼻腔中存在多种不同的血清型和不同的菌株，必须用与所见病例有关的特定菌株进行病学研究，因新的分子生物学技术对同一血清型的不同菌株进行比较，能很快使我们更充分地认识该种疾病。对猪链球菌病的认识从病例研究中得出，几乎所有的猪上呼吸道中都携带猪链球菌。事实上，猪链球菌被认为是猪扁桃体和鼻腔内的正常栖菌，一些健康的猪肺中甚至能分离出猪链球菌。因此，不能仅仅以此就作出阳性诊断，每头猪常携带不同血清型的菌株，也可能携带同种血清型的不同菌株。