论文部分内容阅读
细菌演化研究在测序技术的支持下获得了大量成果。研究范围从代表性种类向其他种类持续扩大，研究层次从单一序列迅速推进至整个基因组。本文以细菌演化的研究对象、研究发现和研究工具为线索，较详细地介绍了近些年来细菌演化研究及所用工具所取得的各项成果。这些成果对揭示生物演化本质、促进分析技术发展、服务生产生活和医疗卫生都有重要意义。
细菌演化研究的进展
【摘 要】
：
细菌演化研究在测序技术的支持下获得了大量成果。研究范围从代表性种类向其他种类持续扩大，研究层次从单一序列迅速推进至整个基因组。本文以细菌演化的研究对象、研究发现和研究工具为线索，较详细地介绍了近些年来细菌演化研究及所用工具所取得的各项成果。这些成果对揭示生物演化本质、促进分析技术发展、服务生产生活和医疗卫生都有重要意义。
【机 构】
：
211166 南京医科大学，生物医学工程与信息学院，生物信息学系
【出 处】
：
中华微生物学和免疫学杂志
【发表日期】
：
2018年38期
其他文献
目的探讨应用改良肱骨髁上阶梯截骨(M-HSSCO)技术治疗儿童肘内翻畸形的可行性及临床疗效。方法回顾性分析2016年6月至2017年6月南京医科大学附属儿童医院收治的25例肘内翻患儿资料，其中男20例，女5例；年龄6～11岁[(8.5±0.3)岁]。术中使用M-HSSCO技术进行截骨矫形，肱骨鹰嘴窝近端0.5～1.0 cm处L形截骨，外侧保留三角骨块，近端截骨线同样为L形截骨，外侧去除三角骨块，以
目的探讨T淋巴细胞亚群分布及稳态变化在男男性行为人群(men who have sex with men，MSM) 艾滋病病毒(human immunodeficiency virus，HIV)感染疾病进展中的作用。方法166例男男性行为人群HIV感染样本，依据感染时间及CD4＋ T淋巴细胞水平分组：早期感染组(early HIV infection，EHI)38例、HIV组94例、AIDS组34
目的研究宿主限制性因子莫罗尼白血病病毒10蛋白(Moloney leukemia virus 10，MOV10)对乙肝病毒(hepatitis B virus, HBV) 复制的调控作用。方法首先在肝癌细胞Huh7中转染HBV复制质粒，探讨HBV复制和MOV10表达的相关性；接着在Huh7中通过siRNA干扰或过表达MOV10，提取病毒核心颗粒的DNA，通过荧光定量PCR分析病毒复制水平的变化；进
目的探讨结核分枝杆菌EF4蛋白在应激条件下的功能表现。方法将编码结核分枝杆菌EF4蛋白的pSMT-EF4质粒转入大肠杆菌BL21，使其表达结核分枝杆菌EF4蛋白，观察在不同应激条件下的生长情况，绘制其生长曲线。结果分别在含氨苄青霉素、G418和链霉素的培养基中，表达结核分枝杆菌EF4蛋白的大肠杆菌BL21的生长情况好于未表达结核分枝杆菌EF4蛋白的对照组，分别在6 h、9 h、2 h后表现出显著性
纤维化(fibrosis)是多种病变的共同病理基础，主要表现为组织内胶原沉积及纤维结缔组织增多，原有的组织结构破坏及功能受损。目前有关纤维化的发病机制尚不明确，亦缺乏有效的治疗与预防手段。近年来，大量的研究表明趋化因子CXCL16及其受体CXCR6在纤维化的发生发展中扮演重要角色。本文从CXCL16/CXCR6的生物学特性及其在纤维化中的作用两个方面进行归纳总结。
目的确定致病性问号钩端螺旋体(简称钩体)LA3304基因产物DAC合成c-di-AMP的活性，LA3303基因产物CdaR增强DAC酶活。方法采用PCR扩增问号钩体黄疸出血群赖型赖株LA3304基因，并构建其原核表达系统。Ni-NTA亲和层析法提纯表达的目的重组蛋白rDAC。采用高效液相色谱法(HPLC)检测rDAC环化ATP底物为c-di-AMP的活性。采用细菌双杂交法检测CdaR与DAC相互作
目的评价环鸟-腺二核苷酸(cGAMP)在非口服幽门螺杆菌蛋白类疫苗研发中作为佐剂的免疫增强效果。方法以cGAMP为佐剂，与幽门螺杆菌蛋白抗原，包括UreA、UreB和NapA混合，通过皮下途径注射免疫BLAB/c小鼠，同时设置单独抗原组和佐剂组对照，以间接ELISA法测定免疫前后血清中抗原特异性IgG抗体和盲肠灌洗液中IgA抗体；流式细胞术分析脾及腹腔淋巴结(MLN)中T淋巴细胞IFN-γ分泌水平
目的初步探讨结膜下注射新型血管内皮生长因子(VEGF)靶向抗体MIL60的眼部药代动力学情况。方法取8～12周龄的健康成年新西兰大白兔20只，用30G注射器于左眼角膜缘后颞上方球结膜下注射1.25 mg/0.05 ml MIL60，以右眼作为对照眼。分别于给药后第5、7、14、21和28天取双眼房水、玻璃体以及外周血，通过ELISA法检测各样本的药物浓度，通过WinNonlin药代动力学软件计算主
目的研究羧肽酶E如何促进淋巴细胞及其亚群跨血管内皮细胞进行迁移。方法利用CRISPR/Cas9技术对MS1细胞上的基因cpe进行敲除；淋巴细胞与血管内皮细胞黏附试验比较淋巴细胞对MS1细胞和敲除细胞Cpe－/－MS1的黏附能力，RT-PCR及流式方法比较MS1细胞和敲除细胞Cpe－/－MS1表面黏附分子的表达；Transwell试验比较淋巴细胞及其亚群穿过MS1细胞和敲除细胞Cpe－/－MS1的能
目的分析河北地区由腺病毒(adenovirus, ADV)感染致急性呼吸系统疾病的分子流行病学以及ADV与其他呼吸道病原体混合感染情况。方法收集河北省儿童医院2017年6月—2018年5月急性呼吸道感染住院儿童痰液标本，经13种呼吸道病原体多重检测试剂筛选出ADV阳性标本并用巢氏PCR方法对其六邻体基因进行扩增且测序分型。结果8 839份标本中，共检出353份ADV阳性标本，阳性率为3.99%。A