【摘 要】
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目的:生物信息学分析SPP1在肝细胞癌(HCC)中的表达及与临床预后的关系,并预测SPP1表达异常的分子机制。方法:GEPIA数据库分析SPP1 mRNA在肝细胞癌中的表达及与患者预后的关系
【机 构】
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武汉大学人民医院消化内科/消化系统疾病湖北省重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金青年科学基金项目（编号：81400624）
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目的:生物信息学分析SPP1在肝细胞癌(HCC)中的表达及与临床预后的关系,并预测SPP1表达异常的分子机制。方法:GEPIA数据库分析SPP1 mRNA在肝细胞癌中的表达及与患者预后的关系;cBioPortal、MethHC、GCBI和StarBase和NetPhos 3. 1 Server等数据库预测SPP1基因突变、启动子区甲基化水平、与SPP1结合的miRNAs转录后调控、蛋白翻译后修饰。结果:SPP1 mRNA在HCC中表达升高,其中SPP1高表达患者的总体预后差(log-rank P=0. 000 11)。HCC中SPP1存在基因扩增和深度缺失。启动子区甲基化水平降低(P<0. 005),并与SPP1表达负相关(R=0. 650,P<0. 000 1)。HCC中miR-146a表达降低,miR-146a能与SPP1的3’-UTR结合,miR-146a与SPP1的共表达有统计学意义(P<0. 000 1);4个激酶unsp、PKC、PKA、CKⅡ能在39个位点将其底物SPP1蛋白磷酸化。结论:生物信息学分析SPP1可作为早期肝细胞癌的潜在诊断指标。其升高可能与SPP1基因组扩增、启动子区去甲基化、转录后miR-146a对其3’-UTR调控、蛋白翻译后磷酸化修饰相关。
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