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磁悬浮转子装配体通常借助过盈配合实现可靠联接，因此产生的模态变化不可避免。针对热套配合的柔性磁悬浮转子系统建立有限元模型，为实现一、二阶弯曲固有频率的准确预测，应用等效及接触理论对模型进行修正，选取合适的修正系数，以精确模型便于控制研究。基于等效模型将过盈问题转化为弹性模量、转动惯量的优化问题，接触模型将过盈量纳入初始几何穿透中，进行预应力下的迭代求解。最后通过模态测试验证仿真分析，结果表明修正后的模型在进行模态预测时的计算误差得到改善。