目的了解广州市禽类市场休市期间外环境中H5N6禽流感病毒流行特点,评价实行活禽市场休市措施对控制H5N6禽流感病毒污染的效果。方法 2017年2-3月春季休市期间,中心城区和周边城区各随机选取3个禽类市场,采集不同类型拭子标本,通过荧光定量RT-PCR方法进行A型、H5亚型和N6亚型禽流感病毒核酸检测,分析外环境中H5N6禽流感病毒的三间分布情况。结果共检测的4 160份标本中,A型禽流感病毒阳性标本657份(15.79%),H5亚型禽流感病毒阳性标本82份(1.97%),H5N6亚型禽流感病毒阳性标本77份(1.85%)。经2月份休市,H5N6阳性率从最高的27.78%开始下降,在休市的3天内H5N6阳性率缓慢下降,从复市开始,将近两周的时间内H5N6病毒几乎一直处于未检出的状态。中心城区H5N6阳性标本28份(1.28%),周边城区H5N6阳性标本39份(2.71%),两区域H5N6检测阳性率有统计学差异(χ~2=9.816,P=0.002)。饮水类标本H5和H5N6检出率最高(7/178,3.93%),污水、称台、冰箱和光鸡标本H5和H5N6检出率最低(未检出)。结论广州市H5亚型禽流感病毒以H5N6亚型为主,禽类饮用水标本中H5N6病毒污染最为严重。建议在H5N6禽流感高发的冬春季节及时实施"休市",特别是针对污染率较高的周边城区,从而降低人感染H5N6亚型禽流感病毒的感染风险。