延边牛PLIN2基因CDS区克隆、生物信息学分析及其表达规律研究

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xuxiyao4444
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究旨在克隆延边牛脂肪分化相关蛋白PLI N 2基因完整CDS区,通过生物信息学分析PLI N 2基因CDS区序列和蛋白质基本特性,探讨其在延边牛不同组织及前体脂肪细胞成脂过程中的表达规律.选取18月龄去势的延边牛为研究对象,利用RT-PCR和基因克隆获得延边牛PLI N 2基因,与其他物种进行同源性比对及系统进化树构建,利用生物信息学方法预测PLIN2编码蛋白质的理化性质、潜在磷酸化位点及糖基化位点、二硫键分析、信号肽、亚细胞定位、蛋白高级结构,利用实时荧光定量PCR检测PLI N 2基因在延边牛不同组织中的表达水平.结果显示,延边牛PLI N 2基因CDS长1353 bp,编码450个氨基酸;同源性比对发现延边牛PLI N 2基因与黄牛、水牛、绵羊、山羊、野猪、人、小鼠和野鸡的同源性分别为100%、98.7%、96.7%、97.1%、85.5%、86.3%、47.3%和49.1%;系统进化树表明,延边牛与黄牛、水牛的亲缘关系最近,与野鸡的亲缘关系最远.PLIN2蛋白为不稳定蛋白,具有一定亲水性,存在61个潜在的磷酸化位点、16个O-糖基化潜在位点、12个N-糖基化潜在位点,存在2个二硫键,不存在信号肽,主要分布于细胞核中,细胞质和线粒体中有少量分布.PLIN2蛋白高级结构预测该蛋白是由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲和β-转角组成,为混合型蛋白,通过无规则卷曲连接,以α-螺旋为主.实时荧光定量PCR结果显示,PLI N 2基因在延边牛小肠组织中表达量最高,其次为背最长肌和肾脏组织.本研究结果可为进一步研究PLI N 2基因的功能提供借鉴.
其他文献
目的 建立表面增强拉曼光谱法(surface enhanced Raman spectroscopy,SERS)快速测定减肥类保健食品中比沙可啶的分析方法.方法 激发波长785 nm±0.5 nm,光谱覆盖范围为300~230
在新冠肺炎疫情常态化下,2021年白菜类蔬菜良种繁育工作具有繁种价格升高、极端天气危害部分商品种子亲本等特点.为确保取得好收成,育种单位和制种企业可根据良种繁育工作建
期刊
目的 建立重组酶介导扩增技术(recombinase aided amplification,RAA)快速检测单核细胞增生李斯特菌的方法.方法 以单核细胞增生李斯特菌的hlyA基因作为靶序列,设计引物和探
卵泡从原始卵泡发育为成熟卵泡,直至排卵、黄体发育等过程都受到精密的调控,产生大量的优势卵泡是绵羊产多羔及实现快速扩繁的关键因素.研究发现,相关信号通路和转录因子通过
目的 建立高效液相色谱法(high performance liquid chromatography,HPLC)同时测定榅桲籽中蔷薇酸和委陵菜酸含量的分析方法.方法 样品经石油醚脱脂后,用甲醇超声提取,采用Kr
高中劳动技术教育不仅是素质教育的重要载体,也是推进新课程改革的重要方面,更能培养学生的创新思维。因此,在高中教学中要切实改变教育观念,给予劳动技术教育以同等的重视,
传统教育对学生而言,课堂效率是低下,甚至是无效的。沉重的学习负担使学生感到学习压力很大。实行高效的教学方法是势在必行的,可以有效地帮助学生提升学生效率。成为学习的
本研究旨在通过构建非洲猪瘟病毒(ASFV)B438L基因原核表达系统表达p49重组蛋白,并制备抗p49蛋白的多克隆抗体.根据ASFV Georgia 2007/1(GenBank登录号:FR682468.1)公布的基因
为分析云南省虫媒病毒的种类与遗传特征,在云南省师宗县采集库蠓进行病毒的分离与鉴定;通过全长cDNA扩增与高通量测序技术获取病毒全基因组序列,进行序列比对与系统发生树构
作为班主任,要管理好班级,需要解决和调节的方面有很多。主要因素是教师的个人魅力,这在课堂管理中是至关重要的。人格指的是“一个人的个人道德品质和能力”。人格魅力即个