生物芯片高通量检测卵巢癌转录组差异表达基因的生物标记识别

来源 :临床检验杂志(电子版) | 被引量 : 0次 | 上传用户：xinran200391127

【摘要】

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目的探究卵巢癌中基因的表达情况并识别重要的代谢通路。方法从ArrayExpress数据库下载卵巢癌芯片数据，使用rankproduct方法识别差异表达基因；利用STRING900、STRING、Bossi&Le

【作者】

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何文龙隋杏玲

【机构】

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天津医科大学公共卫生学院,济南基因云馆数字图书馆

【出处】

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临床检验杂志(电子版)

【发表日期】

：

2017年1期

【关键词】

：

卵巢癌差异表达基因通路富集分析网络构建

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目的探究卵巢癌中基因的表达情况并识别重要的代谢通路。方法从ArrayExpress数据库下载卵巢癌芯片数据，使用rankproduct方法识别差异表达基因；利用STRING900、STRING、Bossi&Lehner和PSICQUIC四个数据库对这些差异基因进行KEGG通路富集分析，并运用R语言运算取这些通路的交集，以找出在卵巢癌发生中重要的代谢通路；最后构建各通路中重叠基因的网络节点图，以识别通路中的重要基因。结果在卵巢癌中共检测到1,732个差异表达基因和176条代谢通路。其中，p53信号通

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