宁波地区肠道病毒71型VP1基因特征分析

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目的 了解宁波地区肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)流行株VP1基因特征.方法 采集手足口病患者的样本进行病毒分离和鉴定,用逆转录-聚合酶链反应对EV71流行株VP1进行扩增和测序.对流行株VP1进行进化分析,并将流行株VP1与各基因型代表株进行序列比对.同时测定EV71流行株的半数组织培养感染量(median tissue culture infective dose,TCID50).结果 2008-2009年,宁波地区分离出23株病毒,其中6株为EV71.EV71流行株VP1进化分析显示,6株EV71流行株与C4亚型代表株聚于同一分支,流行株VP1的核苷酸和氨基酸序列与C4亚型代表株的同源性最高,分别为92.0%~93.1%和98.9%~99.3%.6株EV71流行株的滴度为101.16~103.33TCID50/ml.结论 2008-2009年宁波地区EV71流行株属于C4亚型.
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