一例复杂性皮质发育不良伴脑畸形患儿的临床与n KIF2A基因变异分析n

来源 :中华医学遗传学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:LIGUOQIANG630
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目的:探讨临床1例复杂性皮质发育不良伴脑畸形3型(cortical dysplasia, complex, with other brain malformations 3,CDCBM3)患儿的基因型与表型关系。方法:收集先证者及其父母外周血,提取基因组DNA,采用全外显子测序对先证者进行检测,并应用Sanger测序对先证者及父母进行验证。结果:先证者为1例1岁2个月男性患儿,表现为运动发育迟缓,巨脑回,严重认知障碍,语言缺失,先天性喉骨软化等多发性先天异常。全外显子测序检测到患儿n KIF2A基因发生了c.952G>A( p.Gly318Arg)杂合错义变异(GRCh37/hg19),该变异位于驱动蛋白运动结构域中的ATP核苷酸结合区,高度保守(PM1);在正常人群数据库频率为0(PM2);多种计算机软件预测有害(PP3);该变异在以往的文献中未有报道,Sanger测序验证显示患儿父母均未检测到该变异,因此患儿的变异为新发(PS2)。根据ACMG指南评估为临床可能致病性变异(PS2+PM1+PM2+PP3)。与已报道的CDCBM3患儿的临床表型进行比较,本例患儿的先天性喉骨软化在以往的文献中未见描述。n 结论:本文研究扩展了n KIF2A基因变异谱并丰富了CDCBM3临床表型谱。n “,”Objective:To explore the genetic basis for a child featuring complex cortical dysplasia and other brain malformations (CDCBM3).Methods:Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples from the patient and his parents. Whole exome sequencing (WES) was carried out for the family trio. Suspected variant was verified by Sanger sequencing.Results:The proband, a 1-year-and-2-month old Chinese boy, had presented with motor developmental delay, lissencephaly, severe cognitive impairments, absent speech and congenital laryngomalacia. WES revealed that he has harbored a heterozygous missense variant of the n KIF2A gene, namely NM_001098511.2: c. 952G>A, p. Gly318Arg (GRCh37/hg19). The highly conserved residue is located around the ATP nucleotide-binding pocket in the kinesin motor domain (PM1). The variant was not found in the Genome Aggregation Database and the 1000 Genomes Project (PM2), and was predicted to be deleterious on the gene product by multiple in silico prediction tools (PP3). This variant was unreported previously and wasn de novo in origin (PS2). Based on the ACMG guidelines, it was categorized as likely pathogenic (PS2+ PM1+ PM2+ PP3). Furthermore, the congenital laryngomalacia found in our patient was absent in previously reported CDCBM3 cases.n Conclusion:The novel variant of the n KIF2A gene probably underlay the disorders in the proband. Above finding has expanded the phenotypic and mutational spectrum of CDCBM3.n
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目的:对一例胼胝体发育不全并伴有其他脑部畸形的胎儿进行遗传学分析,以明确其致病原因。方法:应用全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)技术筛选与胎儿表型相符合的致病变异,并对先证者及其父母进行Sanger测序验证。结果:WES发现胎儿n TUBB2B基因第4外显子存在一处新发错义变异c.758T>A(p.L253Q),既往未见报道。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,n TUBB2B基因c.758T>A为可能致病性变异。生物信息学分析提
目的:对1例男性乳腺癌患者的基因组变异进行分析,为检测后的遗传咨询提供依据。方法:检测前了解家族史、医疗史,告知被检者检测潜在的风险及可能的检测结果,利用二代测序技术对先证者进行全外显子组检测,应用Sanger测序对先证者及家系成员进行变异位点验证。结果:二代测序结果显示先证者n BRCA2基因存在c.6018dupT(p.Thr2007Tyr*11)杂合变异,是未报道过的新变异,属于移码变异。该变异会导致n BRCA2基因mRNA的翻译提前终止,产生截短的BRCA2蛋白,根据美国医学
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