GEO数据库分析环状RNA在乳腺癌组织中的表达

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目的采用生物信息学方法探究环状RNA在乳腺癌侵袭转移中的作用。方法从GEO数据库中检索并下载乳腺癌组织的芯片数据,利用R软件对4对Luminal A型乳腺癌组织和4对三阴性乳腺癌组织进行差异分析,然后利用miRanda软件和RNAhybrid软件对差异表达的环状RNA和miRNAs之间的相互作用进行预测。通过TCGA数据库分析环状RNA的亲本基因在乳腺癌组织中的表达。结果通过差异分析,发现共有27个环状RNA异常表达,其中6个环状RNA上调,21个环状RNA下调;通过软件预测构建了环状RNA/miRNAs
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