用原子力显微镜表征K562/A02细胞Mdr1基因DNA的实验研究

来源 :中国医学物理学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xixiangreng
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目的:运用原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)表征K562/A02细胞多药耐药基因Mdr1启动子区域的DNA.材料与方法:PCR扩增K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域769bp的DNA,产物纯化后,分别按终浓度为5ng/μl、10 ng/μ1、20 ng/μl固定在用1 ng/μl L型多聚赖氨酸预先处理过的新剥离的云母片制备成观测样本.原子力显微镜观测样本,获取扫描图像后追踪DNA分子轮廓,进行模数分析.结果:用原子力显微镜能够成功地表征K562/A02 mdr1基因启动子区域769bp的DNA片段,获得清晰的二维及三维图像.我们推测原子力显微镜观测该长度的DNA样本的最佳浓度为10 ng/ul左右,在此浓度下对其三维图像进行图像处理后分析的DNA分子轮廓结果如下:DNA分子链的长度为(260.13±2.29)nm(n=50),平均宽度为(11.88±0.92)nm,双链的平均高度为1.2 nm.结论:原子力显微镜能够成功地表征K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域的DNA,获得清晰的二维及三维图象,并且能够直观地分析DNA轮廓,为进一步在分子层面上探讨研究Mdr1基因遗传信息提供了一种新的简单、直观、可靠的方法.
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