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胃肠的道使用忍耐和控制发炎的一个系统在内脏限制反应到饮食或导出细菌的抗原。当这个复杂系统垮掉时，由在产生有免疫力的反应可以导致的一个遗传上预先安排的个人的化学或病原的侮辱的任何一个煽动性的肠疾病。尽管煽动性的肠疾病的 aetiopathogenesis 仍然保持未解决，当前的证据显示肠的上皮的障碍功能的有缺点的 T 房间 apoptosis 和缺陷起重要作用。在煽动性的肠疾病，巨噬细胞的激活似乎象象 TNF-alpha， IL-1 和 IL-6 那样的导出巨噬细胞的 cytokines 的增加的生产一样重