【摘 要】
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提出了一种应用磁性颗粒和通用连接子扩增技术(Linker-PCR)的多位点单核苷酸多态性(SNP)分型方法.该方法首先通过酶切将样本基因组DNA打断,然后将通用连接子通过T4DNA连接酶
【机 构】
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东南大学生物电子学国家重点实验室; 湖南工业大学绿色包装与生物纳米技术应用湖南省重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金(Nos.60801007,90606027);863国家高技术研究发展计划(Nos.2006AA02Z133,2007AA022007);国家重点基础研究发展计划-纳米研究重大科学研究计划(No.2007CB936104);中国博士后科学基金(No.20080430160);江苏省博士后科研资助计划(No.0801004B);湖南省教育厅科研基金(No.08B018);江苏省
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提出了一种应用磁性颗粒和通用连接子扩增技术(Linker-PCR)的多位点单核苷酸多态性(SNP)分型方法.该方法首先通过酶切将样本基因组DNA打断,然后将通用连接子通过T4DNA连接酶与各个酶切片段连接,利用生物素标记的通用引物将样本进行全基因组扩增.扩增后,将生物素标记的Linker-PCR扩增产物固定到亲合素修饰的磁性颗粒表面,通过与双色荧光标记的等位基因特异性探针杂交,对待测位点进行分型.利用该方法,我们对10个样本MTHFR基因上的2个SNP位点进行了分型,分型结果准确、正错配信号比大于3.由于利用Linker-PCR技术来实现对靶序列的全基因组扩增,该方法非常适用于大量样本的多基因多位点的SNP分型研究.
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