目的了解疾病预防控制机构传染病流行病学能力,为提高传染病防控水平提供依据。方法参照美国公共卫生机构的流行病学能力评价工具,设计《疾病预防控制机构传染病流行病学能力调查表》,调查2015年浙江省宁波市、绍兴市、衢州市25家市、县级疾病预防控制机构(疾控机构)的传染病流行病学能力,采用描述性流行病学方法分析和评价。结果 25家疾控机构的法定传染病监测能力达到良好的为19家(76.00%),非法定传染病监测能力达到良好的为2家(8.00%)。24家(96.00%)疾控机构认为人力不足为限制机构传染病流行病学能力的最主要因素;20家(80.00%)疾控机构传染病流行病学人员在学术期刊上发表文章的能力达到良好,但科研能力达到良好的仅为3家(12.00%);培训下级机构能力达到良好的仅为10家(40.00%),且有2家(8.00%)为差。不同市、县级疾控机构仅在非法定传染病监测能力方面差异有统计学意义(P=0.03)。结论疾控机构整体具备较好的传染病流行病学能力,但在非法定传染病监测、科研和培训下级机构等方面的能力有待提高和加强。