[目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究。该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及正常肝组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF3基因对肝细胞癌患者预后的影响。[方法]利用Oncomine数据库分析MTERF3基因mRNA在正常肝组织和肝细胞癌组织中的表达变化。通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)人体正常组织和其相应的肿瘤组织中MTERF3基因的表达差异。通过c Bioportal分析MTERF3基因在肝细胞癌组织中的突变情况。经MethHC数据库分析肝细胞癌和正常肝组织中MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平的差异。利用Onco Lnc数据库对MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验。在String-DB数据库中探索在线粒体DNA表达调控过程中与MTERF3基因关系密切的相关基因。[结果]与正常肝组织相比,肝细胞癌组织中MTERF3基因在mRNA水平呈显著高表达(P≤0. 05),MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平显著降低(P≤0. 05)。肝细胞癌组织中MTERF3基因存在错义突变,导致其编码蛋白质的243位甲硫氨酸突变为缬氨酸(M243V)。MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者的总生存时间存在相关性(Logrank P≤0. 05),MTERF3基因高表达的肝细胞癌患者总生存时间显著缩短。MFN1、MFN2、VDAC1、ATG12、UBA52、UBB、UBC、PINK1、SQSTM1、RPS27A等基因与MTERF3基因有明显的相互作用。[结论]大样本数据挖掘能迅速地获取肝细胞癌组织中MTERF3基因表达的相关信息,为深入研究MTERF3基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制奠定基础。