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随着经济的发展和人们生活水平的不断提高，人们对食品的要求已从单纯的温饱转向了“功能、营养和健康”的新要求；膳食结构和组成是影响健康和疾病发生的重要因素，在人们多年以来追求中医、西医或中西结合预防和治疗疾病模式外，渐渐转“医补”为“食疗”，期望利用食品的功能性达到促进健康和干预疾病的目的。因此，以功能性食品微生物为核心的功能性食品如益生菌、微生物源PUFA、红曲等已逐渐深入人心，这也推动了功能性食品微生物资源开发与应用的发展。在21世纪生物技术大发展的时代背景下，利用食品微生物的特定功能性质，开发系列健康的功能食品成为重要的发展趋势。目前，以功能性微生物为核心的技术与产品已广泛用于食品、保健品、医药和饲料行业，应用前景十分广阔。