蛋白质空间结构属性与全基因组微生物耐热性的关系

来源 :中国生物化学与分子生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:henrychen999
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溶剂接触表面积、空腔个数和体积、紧密度、疏水性以及温度因子是影响蛋白质耐热的主要三维结构参数.挑选NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,分析这些因素对细菌类和古细菌类微生物耐热性的影响.结果表明:(1)古细菌类蛋白质的空腔个数和体积与耐热性无关,极性面积和表面残基个数随耐热性增加而降低;(2)超高温细菌类蛋白质的分子量比较小,空腔个数和体积都小于常温蛋白质,而且空腔个数对稳定性的贡献大于空腔体积;(3)无论是古细菌还是细菌类蛋白质,疏水性和紧密度都不
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