【摘 要】
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为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠
【机 构】
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华中农业大学水产学院,广东佛山市南海百容水产良种有限公司
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(31872542);中央高校基本业务费专项(2013PY067)
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为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30192个)和31.9%(16802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32~35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧
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